حمّلت الدراسة المجلس مسؤولية فشله في دمج التشكيلات العسكرية ضمن وزارتي الدفاع والداخلية، مشيرة إلى أن المجلس الانتقالي الجنوبي استغل وجوده لتعزيز تمدده العسكري في شبوة وأبين وسقطرى، ولتوسيع نفوذه في حضرموت.

حذّر الائتلاف الوطني الجنوبي، من حالة التراخي والتصدع في صفوف الشرعية، مستنكراً في ذات الوقت استمرار ظاهرة التشكيلات العسكرية خارج مؤسسات الدولة.